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次世代定序癌症17基因檢測(17 NGS Somatic Mutations in Cancer)
2024-11-19
採用 次世代定序(NGS, Next-Generation Sequencing)癌症 17 基因檢測 的原因,主要有以下幾點臨床及技術上的優勢,總結如下:
1. 精準醫療的需求: 癌症治療進入了「精準醫療」時代,治療策略越來越依賴腫瘤的基因特徵,而不僅僅是病理形態或器官來源。
✅ 不同病人、同樣癌別,其基因變異可能完全不同
✅ 基因檢測可協助找到可用的標靶治療藥物、或免疫治療指標
例如:EGFR、ALK、ROS1 變異 → 可用對應的標靶藥物 BRCA1/2 突變 → PARP 抑制劑 MSI-high → 免疫檢查點抑制劑
2. 覆蓋多基因、效率高: 傳統檢測一次通常只能檢測 1–2 個基因(如單獨測 EGFR 或 KRAS),NGS 可以一次性檢測 17 個與癌症高度相關的基因,節省時間和樣本量。
NGS 檢測的 17 個常見癌症基因通常包括:EGFR、KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA、ERBB2、ALK、ROS1、MET、RET、BRCA1、BRCA2、TP53、PTEN、NOTCH1、NTRK、MSH2/MSH6 等。一次性篩查可以減少「漏診」潛在的驅動基因。
3. 靈敏度高、檢出率佳: NGS 能夠檢測低頻率的突變(突變頻率可低至 1–5%),比傳統 Sanger 定序敏感許多。對於腫瘤異質性、微量樣本(如穿刺活檢、液態活檢)的檢測特別有價值。
4. 樣本利用率高: 只需要很少量的組織或血液即可完成多基因檢測,特別適合:
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樣本難以取得的肺癌、胰臟癌患者
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循環腫瘤 DNA(液態活檢)
5. 指引推薦與規範化: 許多國際與國家級臨床指引(如 NCCN、ESMO)已經建議晚期非小細胞肺癌、結直腸癌、卵巢癌等患者進行多基因檢測,以輔助治療決策。
6. 預後及耐藥監測: 除了協助初期的藥物選擇外,NGS 也能夠:
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監測耐藥突變(如 T790M)
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評估腫瘤突變負荷(TMB)、微衛星不穩定性(MSI)
總結:採用 NGS 17 基因檢測的核心理由,是它能在單次檢測中快速、全面、高效地找到對治療具有意義的驅動基因或標誌物,幫助臨床制定最合適的治療計畫,減少不必要的用藥風險,提高患者預後。
分析方法:
1.萃取福馬林固定石蠟包埋組織或全血游離的DNA
2.以Roche之AVENIO Target Panel進行基因片段的擴增和建庫後
3.以illumina公司的次世代定序分析儀進行序列定序
4.所得之序列再利用羅氏Roche Oncology Analysis Software進行變異點分析
5.同時也使用大安聯合生物資訊平台或羅氏NAVIFY Mutation Profiler比對已核淮使用或臨床試驗中的基因突變對應之適應症、癌症等資訊
臨床意義
本檢測為分析福馬林固定石蠟包埋組織或全血游離的DNA是否帶有17個特定基因的突變點,包含四種主要的突變類型:
1.單核苷酸變異 (single nucleotide variations, SNVs)
2.插入或缺失 (Insertion and deletion, Indels)
3.拷貝數變異 (Copy number variations, CNVs)
4.基因融合 (fusion)
品質良好的檢體各突變類型的靈敏度、特異性及再現性都可以達到99%以上。
檢測流程
1.與醫師或專業諮詢師溝通
2.填寫同意書採集 2~3ml周邊血或石蠟包埋的組織玻片或蠟卷檢體
3.萃取全基因體DNA
4.針對特定基因進行次世代核酸定序 (NGS)及結果分析
5.專業醫師簽核、報告發送
檢測標的
ALK、APC、BRAF、BRCA1、BRCA2、DPYD、EGFR、ERBB2、KIT、KRAS、MET、NRAS、PDGFRA、RET、ROS1、TP53、UGT1A1
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此套組包含17個與9種癌症(肺癌、大腸直腸癌、乳癌、卵巢癌、胃癌、腦瘤、黑色素細胞癌、甲狀腺癌跟胰臟癌)治療或預後相關的基因。

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符合美國National Comprehensive Cancer Network® (NCCN®)指引。

健康照護
本檢測以提供臨床醫師用藥建議為目的,對於尚無用藥資訊之基因變異則不會納入報告中;而隨著臨床研究及應用的不斷更新,不排除未來將更新基因突變、用藥資訊及臨床解釋,受檢者仍需配合醫師的指示,進行合適的治療。
參考資料
大安聯合:次世代定序癌症17基因檢測
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